Я вот тоже стою на распутье, почитал статьи в инете, в общем лучше выходит всеже два оптерона (сравнивались топовые процессоры), но вот цена выходит в сторону двух ксеонов. Т.к. у меня сумма критична, то я для себя выбрал следующее (игровой сервер, фтп, веб, sql):
ASUS NCT-D (2xS604, E7525 (800FSB, DDR2-400REG ECC), PCI-E, Video, PATA, SATAraid, Sound, GbLan, ATX)
2хSocket 604 Pentium IV Xeon 1024k FSB800 2.8Ггц
Мамка взята на вырост, т.к. серверы довольно проблематично апгредить, а процессор взят по средней цене из всех моделей. У ксеонов плюс в технологии HT что дает плюсы если будут запущено много загруженых процессов. У оптеронов же лучше работа с памятью, т.к. в нем встроен контролер памяти.
И естественно все зависит от конкретных задач, если в деньгах нет проблем, то выбирай Атлоны.
Ссылочка на сравнение _http://www.nix.ru/news/articles/reviews/cpu/xeon-opteron/h01.html