Если система ХР, то была аналогичная ситуация...
Дело в том, что панель задач состоит из ряда "панелей" каждая из которых выводит свою инфу. Т. е. в твоем случае "панель" отражающая запущенные приложения, по какой-то причине, оказалась "задвинутой" в невидимую область экрана (общей панели). Тебе нужно снять галку фиксации панели задач и "поработать" (подвигать) внутренние "панели" - добиться такого их расположения, когда все будут нормально и в нужных местах отображаться.