Было такое на E-Tower бился несколько месяцев. Ничего не помогало. Сдохла батарейка (начало сбиваться системное время, теряться диски.
Поменял батарейки... И глаза на лоб полезли. Начал отлично выключаться. Вывод:
Выйми батарейку (круглая 3V), подожди 1/2 часа (лучше больше), поставь на место батарейку. Выставь время. Должно помочь.
До этого несколько раз пытался обнулить BIOS, даже перекллючая перемычку, ничего не получалось.
P.S. когда ставил новую батарейту перепутал полярность. BIOS не пострадал.